病原微生物是指可以侵人體，在宿主中生長繁殖、釋放毒性物質(zhì)等引起機(jī)體不同程度病理變化、發(fā)生感染的微生物，包括細(xì)菌、病毒、真菌、寄生蟲、衣原體、支原體等。病原微生物檢測(cè)并非新領(lǐng)域，基于病原學(xué)證據(jù)的抗感染一直都是臨床診療的'金標(biāo)準(zhǔn)'。如果能盡早識(shí)別致病病原、啟動(dòng)恰當(dāng)?shù)目垢腥痉桨缚筛纳苹颊哳A(yù)后，尤其是重癥感染者。病原微生物檢測(cè)在感染判定中意義重大，越來越多的檢測(cè)技術(shù)引入臨床，除了傳統(tǒng)的檢測(cè)方法如涂片染色、培養(yǎng)分離、免疫學(xué)技術(shù)、核酸檢測(cè)等，還有新興的二代測(cè)序技術(shù)(Next-generationsequencing，NGS)等。

　　病原微生物檢測(cè)細(xì)菌的致病物質(zhì)細(xì)菌的致病物質(zhì)主要包括細(xì)菌的菌體表面結(jié)構(gòu)、侵襲性酶及毒素。

　　菌體表面結(jié)構(gòu)有兩類，一類具有黏附作用的結(jié)構(gòu)，如磷壁酸、多包被、菌毛等；另一類是具有抗吞噬作用的結(jié)構(gòu)，如莢膜、微莢膜、A型鏈球菌的M蛋白、金葡菌的A蛋白等。侵襲性酶是細(xì)菌合成分泌的胞外酶，一種有抗吞噬作用的酶，如黃色葡萄球菌產(chǎn)生的血漿凝固酶，可在細(xì)菌周圍形成纖維蛋白包裹層，抵抗人體吞噬細(xì)胞和補(bǔ)體、抗體的作用，保護(hù)細(xì)菌。另一種可幫助細(xì)菌在體內(nèi)擴(kuò)散的酶，如A型鏈球菌產(chǎn)生的透明質(zhì)酸酶。

　　細(xì)菌的毒素有內(nèi)毒素和外毒素。內(nèi)毒素是革蘭氏陰性細(xì)菌細(xì)胞壁的脂多糖，在細(xì)菌死亡裂解時(shí)釋放，對(duì)人和動(dòng)物有毒性，被稱為內(nèi)毒素，其主要成分是類脂A。由于多數(shù)革蘭氏陰性細(xì)菌的內(nèi)毒素類脂A化學(xué)組成相似，因此對(duì)人類產(chǎn)生的致病作用也相似，主要是引起機(jī)體發(fā)熱、白細(xì)胞數(shù)量的改變、內(nèi)毒素血癥和休克、彌散性血管內(nèi)凝血(DIC)等。重度革蘭氏陰性細(xì)菌感染時(shí)，大量內(nèi)毒素直接激活凝血系統(tǒng)，導(dǎo)致嚴(yán)重的臨床綜合征而死亡。外毒素是由活致病菌產(chǎn)生的蛋白性物質(zhì)，又稱為分泌性毒素，毒性強(qiáng)烈且具有組織器官特異性。根據(jù)外毒素作用靶細(xì)胞的不同，外毒素可分為神經(jīng)毒素、細(xì)胞毒素和腸毒素。