病原微生物是指可以侵人體，在宿主中生長繁殖、釋放毒性物質等引起機體不同程度病理變化、發生感染的微生物，包括細菌、病毒、真菌、寄生蟲、衣原體、支原體等。病原微生物檢測并非新領域，基于病原學證據的抗感染一直都是臨床診療的'金標準'。如果能盡早識別致病病原、啟動恰當的抗感染方案可改善患者預后，尤其是重癥感染者。病原微生物檢測在感染判定中意義重大，越來越多的檢測技術引入臨床，除了傳統的檢測方法如涂片染色、培養分離、免疫學技術、核酸檢測等，還有新興的二代測序技術(Next-generationsequencing，NGS)等。

　　病原微生物檢測介紹病原體耐藥及毒力特征檢測：

　　在當前的抗生素不規范使用以及宿主免疫等重重壓力下，病原體勢必在毒性以及耐藥方面有進化。這種高毒性的以及高耐藥性的菌株往往是導致感染性疾病發病率、死亡率居高不下的重要原因。

　　臨床上耐藥性及毒性檢測方法主要是體外藥物敏感性試驗、耐藥菌表型檢測等方法。這些方法操作繁瑣，且較費時、費力。NGS技術通量高、快速，在一次測序反應中即可獲得細菌整個基因組的耐藥、毒力等相關基因信息，有助于揭示病原體毒力及耐藥機制，對臨床治療及指導用藥均具有重要意義。